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【RNA提取】RNA抽提的三大紀律八項注意!
發(fā)布時間: 2021-08-30 點擊次數(shù): 3189次今天我們談一談 RNA 抽提的問題。為了方便大家記憶,總結(jié)出了“三大紀律八項注意"。
紀律一:無外源酶的污染。
外源酶會造成 RNA 的降解,造成 RNA 得率太低,或者*失敗。而外源酶又是無處不在的。這就要求注意以下三點:
注意一:嚴格戴好口罩,手套。手指和呼吸時重要的外源酶的來源。所以童鞋們做 RNA 抽 提的時候,還是要全副武裝起來。這對自己也是一種保護措施。
注意二:實驗所涉及的離心管,槍頭,移液器,實驗臺面等要*處理。離心管和槍頭要用 DEPC 處理過,單純的消毒滅菌可不行呀。移液器和實驗臺面等要用 75%的酒精擦過。
注意三:實驗所涉及的試劑/溶液,尤其是水,必須確保 RNase-Free。
紀律二:無內(nèi)源酶的活性。
這個和紀律一是一脈相承的。目的都是減少 RNA 的降解,提高最終的得率。而所有的組織都含有內(nèi)源酶,這就要求我們在實驗過程中,千方百計滅活內(nèi)源酶。這也就誕生了下面的四大注意事項:
注意四:選擇合適的勻漿方法。新鮮樣品取材后應(yīng)立即置于液氮中速凍,然后可以移至-70℃ 冰箱保存。在碾磨前,碾磨用具也必須預冷。在碾磨過程中,一邊碾磨,一邊補充液氮。樣品碾碎后,在液氮剛剛揮發(fā)完時,將樣品迅速轉(zhuǎn)移到含裂解液的容器中,立即混勻勻漿。
注意五:選擇合適的裂解液?,F(xiàn)在市場上常用的裂解液幾乎都能抑制 Rnase 活性。但是,高內(nèi)源酶含量的樣品,如肝臟,脾臟等組織,建議使用含苯酚的裂解液。苯酚的滅活內(nèi)源酶的能力是很強的。
注意六:控制好樣品的起始量。如果樣品的塊頭太大,所有的細胞無法迅速和裂解液接觸。里面沒有接觸到細胞的 RNA 很快就會被內(nèi)源酶降解。所以,起始量不要太大。如果塊頭太大,要把它切成小塊小塊的。
紀律三:明確抽提目的。
我們做每一個實驗,甚至每一個步驟,都要清楚這樣子做的目的是什么。RNA 用于不同的實驗,其質(zhì)量的要求是不一樣的。那么,這就誕生了下面的最后兩條紀律:
注意七:任何裂解液系統(tǒng)在接近樣品最大起始量時,抽提成功率急劇下降。所以,要進行樣品的破碎和勻漿。其目的是為了使 RNA *地完整地釋放出來。如果樣品是細胞,則無須破碎即可直接勻漿;如果是組織,甚至器官,那就需要破碎后才能勻漿;如果是酵母菌和細菌,則需要先用相應(yīng)的酶破壁后才能勻漿。
注意八:RNA 抽提成功的一個經(jīng)濟的標準是后續(xù)實驗的一次成功,而不是得率。我們?yōu)槭裁匆樘?RNA?是為了后面的實驗,例如原位雜交,免疫沉淀等等。所以,一定要明確后面到底是要干嘛?cDNA 文庫構(gòu)建要求 RNA 完整而無酶反應(yīng)抑制物殘留;Northern 對 RNA 完整性要求較高,對酶反應(yīng)抑制物殘留要求較低;RT-PCR 對 RNA 完整性要求不太高,但對酶 反應(yīng)抑制物殘留要求嚴格。不用每次都以獲得最高純度的 RNA 為目的,從而造成不必要的浪費。
綜上所述,對大部分實驗者來說,RNA 抽提比 DNA 抽提要困難得多。所以,我們要個個牢記,三大紀律八項注意。